产品简介

Discovery Studio（简称DS），是基于 Pipeline Pilot构建的面向生命科学领域的综合分子建模和模拟平台。交互式强，易于使用的视窗操作界面和经过多年验证的科学算法和集成环境使得Discovery Studio被广泛的用于生命科学的各个研究领域如实验生物学、药物化学、结构生物学、计算生物学和计算化学等。Discovery Studio标准C-S架构保证了方便的数据管理和作业监控，另外DS还可以基于科学信息处理平台Pipeline Pilot（简称PP）或者Perl语言对其功能或界面进行灵活的扩展，让数据的共享和交流变得更为方便和简洁，为研究人员提供灵活易用的生物大分子和小分子研究领域的设计与优化工具。

Discovery Studio是基于Pipeline Pilot构建的面向生命科学领域的综合分子建模和模拟平台。它服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家，应用于蛋白质结构功能研究，以及药物发现。为科学家提供易用的蛋白质模拟、药物的设计与优化工具。通过高质量的图形界面、经多年验证的科学算法以及集成的环境，DS将实验数据的保存、管理与专业水准的建模、模拟工具集成在一起，为研究队伍的合作与信息共享提供平台。

一、科学算法准确可信

Discovery Studio所提供的分子设计与模拟方法中，每个方法所蕴含的科学算法本身都经过详实的验证，并发表在高水平期刊上。

二、可扩展性卓越强大

基于领先的科学信息处理平台Pipeline Pilot（简称PP）建立起来的Discovery Studio软件让数据的共享和交流变得更为方便和简洁。用户可以依托Pipeline Pilot的功能流程定制，制作符合自主需求的科研流程，并加入DS中使用。同时，Pipeline Pilot这个开放平台技术还为使用者整合自己的或第三方的软件工具提供了接口。研究者也可以直接使用Perl脚本语言来调用Discovery Studio的相关功能。

三、使用方式灵活方便

用户可以通过“客户端（client）—服务器（Server）”模式使用Discovery Studio软件。具有高质量图形界面的可视化客户端，和基于计算的服务器端，为用户提供了数据、工作流程和计算资源的共享和合作。

四、应用领域丰富广泛

Discovery Studio以生物大分子、配体小分子的设计与模拟为核心，研究领域包括且不限于：疾病的发病机理研究、新药发现和设计、生物信息学、结构生物学、酶学、免疫学、病毒学、蛋白质工程、肿瘤研究、食品科学、环境毒理研究等。

Q&A

Q1.我不是做药物设计的，也可以用Discovery Studio对我研究的体系做相关模拟计算吗？

Discovery Studio一共包含32个计算模块，涉及大分子和小分子等多种体系。应用领域不止局限于药物相关研究，还在酶工程、免疫学、病毒学、蛋白质工程、食品科学、环境毒理研究等方面都有涉及。

Q2.Discovery Studio可以进行抗体人源化吗？

Discovery Studio有专门的人源化模块。结合经典的MODELER算法和CHARMm力场，Discovery Studio可自动预测并提供异源抗体序列中可人源化突变的残基位点信息及后续人源抗体序列中回复突变位点信息，尽可能减少抗体的异源性并且同时尽可能确保其结构稳定性以及抗原结合的特异性。Discovery Studio人源化的可靠性已得到众多客户的验证和认可。

Q3.Discovery Studio使用困难吗？

Discovery Studio是简单的图形界面，所有的计算模块都可以通过鼠标点击的方式来调用。对于没有使用过Discovery Studio的初学者来说非常容易上手。同时我们也有专门的答疑邮箱和技术团队，您在使用过程中遇到问题可以通过邮件联系我们。我们也有组织不同专题的培训班，可以进行现场上机学习。

Q4.Discovery Studio客户端可以安装在32位WINDOWS操作系统中吗？

从Discovery Studio2019版本开始不再支持32位操作系统，即不能安装在32位的WINDOWS操作系统中，2019之前的版本如2018是有32位安装包，可以正常安装在32位操作系统中使用的。

Q5.Discovery Studio支持的显卡有哪些？

Discovery Studio2019支持的显卡类型见官网http://www.3dsbiovia.com/products/collaborative-science/biovia-discovery-studio/requirements/technical-requirements-2019.html

Q6.Discovery Studio支持哪些操作系统？

Discovery Studio支持常见的WINDOWS和LINUX操作系统，如WIN7SP1、WIN10、WINDOWS SERVER、RHEL6.3+、RHEL7及CentOS7等。

Q7.Discovery Studio分子动力学模拟支持GPU计算吗？

从Discovery Studio2019版本开始，Discovery Studio中的分子动力学模拟程序（CHARMm）支持使用GPU计算，是NAMD使用8个CPU核进行并行计算速度的9倍。

Q8.Discovery Studio动力学有哪些计算引擎？是否支持拉伸动力学和自由能微扰计算（FEP）？

除原有的CHARMm引擎的基础上，还有NAMD计算引擎。给您更多的选择。Discovery Studio CHARMm还支持拉伸动力学模拟，可动态研究配体的去结合过程、通道蛋白中离子/配体的拉离过程以及蛋白的去折叠过程及构象的变化。Discovery Studio的FEP自由能微扰方法可精确计算一系列同系配体同受体的相对结合自由能，更精准的研究不同配体和受体的结合作用。